Für die Bearbeitung komplexer Problemlagen werden Arbeitsgruppen eingesetzt, denen die für den jeweiligen Themenbereich zuständigen Akteure und Experten angehören. In diesen Arbeitsgruppen werden konkrete Probleme diskutiert und Lösungsvorschläge entwickelt, die dann wiederum in das Gesundheitsforum eingebracht werden.

In den Gesundheitsregionen^plus  werden ausgehend vom Gesundheitsforum  zur Bearbeitung der beiden Hauptaufgabengebiete  „Gesundheitsversorgung“sowie „Gesundheitsförderung und Prävention“ Arbeitsgruppen eingerichtet.